MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes L312

Total Repeats: 58324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018642	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	406702776
2	NC_018642	A	9	9	363	371	100 %	0 %	0 %	0 %	406702776
3	NC_018642	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702776
4	NC_018642	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
5	NC_018642	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
6	NC_018642	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
7	NC_018642	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
8	NC_018642	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702776
9	NC_018642	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406702776
10	NC_018642	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702776
11	NC_018642	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
12	NC_018642	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
13	NC_018642	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
14	NC_018642	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	406702776
15	NC_018642	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
16	NC_018642	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
17	NC_018642	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	406702776
18	NC_018642	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
19	NC_018642	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
20	NC_018642	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	406702776
21	NC_018642	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	406702776
22	NC_018642	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702776
23	NC_018642	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	406702776
24	NC_018642	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
25	NC_018642	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702776
26	NC_018642	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
27	NC_018642	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702776
28	NC_018642	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
29	NC_018642	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
30	NC_018642	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
31	NC_018642	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	406702776
32	NC_018642	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	406702776
33	NC_018642	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
34	NC_018642	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702776
35	NC_018642	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	406702776
36	NC_018642	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702776
37	NC_018642	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	406702776
38	NC_018642	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
39	NC_018642	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
40	NC_018642	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
41	NC_018642	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702777
42	NC_018642	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	406702777
43	NC_018642	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702777
44	NC_018642	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702777
45	NC_018642	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	406702777
46	NC_018642	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	406702777
47	NC_018642	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
48	NC_018642	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
49	NC_018642	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	406702777
50	NC_018642	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
51	NC_018642	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
52	NC_018642	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	406702777
53	NC_018642	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702777
54	NC_018642	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702777
55	NC_018642	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702777
56	NC_018642	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702777
57	NC_018642	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
58	NC_018642	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
59	NC_018642	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
60	NC_018642	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702778
61	NC_018642	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	406702778
62	NC_018642	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
63	NC_018642	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
64	NC_018642	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	406702778
65	NC_018642	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	406702778
66	NC_018642	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
67	NC_018642	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
68	NC_018642	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702778
69	NC_018642	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	406702778
70	NC_018642	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
71	NC_018642	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
72	NC_018642	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702778
73	NC_018642	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	406702778
74	NC_018642	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	406702778
75	NC_018642	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	406702778
76	NC_018642	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702778
77	NC_018642	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	406702778
78	NC_018642	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702778
79	NC_018642	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	406702778
80	NC_018642	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702778
81	NC_018642	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702778
82	NC_018642	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702778
83	NC_018642	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702778
84	NC_018642	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702778
85	NC_018642	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
86	NC_018642	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
87	NC_018642	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
88	NC_018642	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
89	NC_018642	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	406702778
90	NC_018642	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
91	NC_018642	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
92	NC_018642	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	406702778
93	NC_018642	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702778
94	NC_018642	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	406702778
95	NC_018642	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
96	NC_018642	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	406702779
97	NC_018642	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702779
98	NC_018642	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406702779
99	NC_018642	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	406702780
100	NC_018642	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406702780
101	NC_018642	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702780
102	NC_018642	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
103	NC_018642	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
104	NC_018642	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	406702780
105	NC_018642	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
106	NC_018642	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	406702780
107	NC_018642	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702780
108	NC_018642	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702780
109	NC_018642	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	406702780
110	NC_018642	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	406702780
111	NC_018642	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702780
112	NC_018642	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
113	NC_018642	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
114	NC_018642	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702780
115	NC_018642	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
116	NC_018642	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
117	NC_018642	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
118	NC_018642	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
119	NC_018642	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	406702780
120	NC_018642	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
121	NC_018642	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702781
122	NC_018642	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
123	NC_018642	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406702781
124	NC_018642	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	406702781
125	NC_018642	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702781
126	NC_018642	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
127	NC_018642	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702781
128	NC_018642	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
129	NC_018642	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
130	NC_018642	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
131	NC_018642	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702781
132	NC_018642	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406702781
133	NC_018642	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406702781
134	NC_018642	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
135	NC_018642	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	406702781
136	NC_018642	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702781
137	NC_018642	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	406702781
138	NC_018642	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702781
139	NC_018642	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	406702781
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256	NC_018642	AAT	2	6	12334	12339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702784
257	NC_018642	TCG	2	6	12372	12377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702784
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259	NC_018642	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	406702784
260	NC_018642	AGA	2	6	12494	12499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702784
261	NC_018642	ATT	3	9	12512	12520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702784
262	NC_018642	GTT	2	6	12617	12622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702784
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401	NC_018642	A	6	6	20752	20757	100 %	0 %	0 %	0 %	406702792
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